随着科技的发展，人类利用具有感知未来的超能力人——“先知”，能侦查出人的犯罪企图，所以在罪犯犯罪之前，就已经被犯罪预防组织的警察逮捕并获刑。

约翰就是犯罪预防组织的一个主管。在一次通过“先知”成功阻止了一起因外遇引起的双人命案之后，约翰隐约感到了这一套完美的预防犯罪系统中隐含的秘密——少数派报告。系统依赖三个“先知”一起判定某人是否有杀人企图。当出现分歧，按少数服从多数原则定案，但最后若少数一方正确的话，则会秘密保存一份少数派报告。

约翰一觉醒来，突然发现自己已是昔日同事的抓捕对象。约翰唯一的出路就是找到能证明自己清白的那份少数派报告