西历2008年7月,超磁力武在战争中被发动,在一瞬间把一半的地球摧毁。20年后,在残留的小岛上与爷爷相依为命的少年柯南,偶然间在岛上海滩救了科学家的孙女拉娜,野心家们便想捕捉拉娜对其作出威胁。他们杀害了柯南的爷爷,并捉走了拉娜,因此柯南便踏上了拯救拉娜的旅程。