距离第一部很多年后,次界由大和王子的后人大和管理,当中有一座时间塔,由天使昂斯和守护天使麦高看守,恶魔麦昆认为时间塔有宝物而偷跑进去,昂斯和麦高在追捕麦昆其间碰上被封在这里的史巴谢斯(又名超级宙斯),并在时间壶中看到未来次界被洪水淹没,结果昂斯、麦高和麦昆,以及从时间壶走出来的宝芝,一起展开寻找十二颗圣宝石拯救次界的旅程。只是… 因为通信问题,大和只知道麦高等人偷看时间壶,而不知道次界会被洪水淹没,结果派出了手下五侍女出动追捕,另一方面,复活了的恶魔首领史巴地比(超级恶魔)也在全力阻止他们拯救次界… 凤凰武士开始被香港改译成超圣凤凰,并在外传故事出场。